公文與合約履約期限不同 是否會違約 - 公職

小妹有個問題想請教各位先進，
公司目前承接一個政府部門的專案計畫，（勞務類）
合約內容敘明「如經機關退回修正，廠商應於機關通知日（發文日）起
15日曆天內修正完成，並提交...」

我們目前進行到期末報告修正的階段，
並在7/12接到甲方公文「請貴公司於7月16日前依本局書面審查意見列表回復，
並提送修正報告書至本局續審」，(此公文發文日期為7月10日)
另外書面意見內容也要求我們先行提送電子檔給承辦人。

7/13先以電子郵件方式提送給承辦人以後，承辦人說要等科長意見，確認後再送印。
所以到7/24才完成送印跟寄送公文的程序。
如果照合約規定，期限應該是7/24或25（看7/10算不算在內）
這樣子會造成違約嗎？

照理說，
合約是雙方合意，公文是甲方單方面的意見，
應該以合約為主，
但以前沒遇過這種狀況，
不知道有沒有法條可以引用？
還是真的就要被算成違約扣款了？ >"<

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