電腦模擬蛋白質製藥的需求? - 生技

Table of Contents

如果你用現在上市的藥,
用電腦模擬去算,分數一定不是最高的

如果把電腦設定成"上市藥物"為最高分的參數,拿來跑,設計出來的藥物,活性通常不高

我想這就是困境。
不知道到現在為止,有沒有藥物是真的由模擬出來的。

電腦模擬就是模擬,不一定準。

※ 引述《piimaila (肥仔)》之銘言:
: 想請問, 蛋白質製藥預測的整體解決方案
: 例如:
: 利用電腦軟體預估 以下課題
: 多醣體抑制癌症能力(中研院)
: 這種是否有實用性和市場?
: 或市面上已經有類似廠商?
: 當然, 這只是預測, 不可取代人體實驗 動物實驗等
: 但可以大量的減少實驗範圍.
: 弊人想投資類似公司, 但是由於才疏學淺
: 故來此詢問各位先進和專家, 這類型的服務是否有前景呢?

--

All Comments

Callum avatarCallum2013-11-24
同感
Heather avatarHeather2013-11-29
同意。但是有些binding pocket看得到,卻很難設計assay。
這時候只能靠電腦模擬找出最佳的結構了。
Emma avatarEmma2013-11-30
好多年前有一個德國的group號稱找到一個新的binding pocket
可以用來設計藥物治療flu,好像也沒有聽見後續成果出來 XD
Barb Cronin avatarBarb Cronin2013-12-05
事實上, 大部分用電腦模擬 僅限論文, 而事實上是可用
Jessica avatarJessica2013-12-05
在低成本取代高通量篩選上, 電腦模擬目前會沒成果
大多是製藥門檻實在過高, 模擬者又大多是學生之流
自然不太會有啥成果
Mary avatarMary2013-12-08
只是, 光以物理學來說, 電腦模擬是可行的, 目前只卡在
需要動物實驗人體實驗等, 做為初步篩選理當可行才是
Faithe avatarFaithe2013-12-12
如果結合醫藥生技, 理論上應可以做製藥的前端不是?
就是讓藥物都已經理論確定, 藥廠只要做動物和人體實驗
Daniel avatarDaniel2013-12-15
大藥廠也有在做預測啊,但是你最後還是要跟HT篩到的藥一起比
Ingrid avatarIngrid2013-12-16
因為後續實驗的成本太高,時程太長,加上科技日新月異。
Cara avatarCara2013-12-19
HT的效率越來越高。電腦預測相對就沒有優勢了。
Genevieve avatarGenevieve2013-12-24
在前端捨棄HT節省的成本,可能在後面細胞實驗或者動物實驗
Caitlin avatarCaitlin2013-12-27
就要吐出來。HT篩到的藥經過最佳化後通不過動物實驗的也很多
Ina avatarIna2013-12-31
但是預測的方式可以給我們一些information 比如大概哪些
core structure的compound比較有希望 當你在看HT篩出來的結
果的時候,就會心裡有底
Liam avatarLiam2014-01-04
甚至一個compound在HT篩到,電腦又預測到,那就很有希望了
Catherine avatarCatherine2014-01-08
HT跟Modeling都只是藥物設計的一小段....後面還有漫漫長路...
Gilbert avatarGilbert2014-01-09
相對的後面有太多的ADMET-directed structure modification
Noah avatarNoah2014-01-10
由於跟enzyme binding無關,不論是HT或Modeling都看不出來~
Ula avatarUla2014-01-12
所以我說如果piimaila您的公司可以把這個系統做得又快又好
大廠不止會外包他們的計劃 甚至會直接買斷您的公司
Lucy avatarLucy2014-01-15
但前提是您的公司要有獨門技術,不能只是買套裝軟體回來跑..
Charlotte avatarCharlotte2014-01-19
Accelrys
Zenobia avatarZenobia2014-01-24
瞭解了^^ 感謝各位先進的回答
Delia avatarDelia2014-01-25
對了 我想問一下, 為啥要重複做呢? 電腦預測事實上
是採用簡單的物理原則而已, 換言之, 電腦預測不到
Odelette avatarOdelette2014-01-25
或者說預測試失敗的藥物, ht無論如何此藥物也不可能
Noah avatarNoah2014-01-28
結合成功不是? 所以如果電腦預測夠快, 應該在ht之前?
Caitlin avatarCaitlin2014-02-01
甚至可以說, 電腦預測成功ht就必定成功, 這樣若電腦預測
速度比ht快, ht就可以不用做不是?
Yuri avatarYuri2014-02-02
ht預測成功的範圍, 有可能小於電腦預測的範圍嗎?
Agnes avatarAgnes2014-02-04
這是很好的問題。問題有兩個:
1. 用來做model的蛋白質結構是否完全正確?
Tristan Cohan avatarTristan Cohan2014-02-07
2. 你的資料庫裡面的compound是否足夠多?
Christine avatarChristine2014-02-11
恩, 換言之, 電腦預測要實用, 前提必須蛋白質完全正確
Olivia avatarOlivia2014-02-12
且配體要夠多且正確, 我可以這樣理解嗎?
如果能達到以上兩點, 事實上HT可以完全不做, 如果不能
ht還是無法省略的程序. 是否如此呢?
Brianna avatarBrianna2014-02-14
理論上是這樣。但是你還要考量compound-protein binding
的環境,subcellular localization,其他protein的參與
Kyle avatarKyle2014-02-15
modeling省略的東西太多,HT則是直接找有活性的compound
我是不認為最終有用modeling取代HT的一天。
Kyle avatarKyle2014-02-16
還有,你也必須要先知道那個pocket真的是重要的 XD