電腦模擬蛋白質製藥的需求? - 生技

By Edward Lewis
at 2013-11-19T22:21

Table of Contents

如果你用現在上市的藥,
用電腦模擬去算,分數一定不是最高的

如果把電腦設定成"上市藥物"為最高分的參數,拿來跑,設計出來的藥物,活性通常不高

我想這就是困境。
不知道到現在為止,有沒有藥物是真的由模擬出來的。

電腦模擬就是模擬,不一定準。

※ 引述《piimaila (肥仔)》之銘言：
: 想請問, 蛋白質製藥預測的整體解決方案
: 例如:
: 利用電腦軟體預估以下課題
: 多醣體抑制癌症能力(中研院)
: 這種是否有實用性和市場?
: 或市面上已經有類似廠商?
: 當然, 這只是預測, 不可取代人體實驗動物實驗等
: 但可以大量的減少實驗範圍.
: 弊人想投資類似公司, 但是由於才疏學淺
: 故來此詢問各位先進和專家, 這類型的服務是否有前景呢?

--

Tags: 生技

All Comments

By Callum
at 2013-11-24T18:31

同感

By Heather
at 2013-11-29T07:32

同意。但是有些binding pocket看得到，卻很難設計assay。
這時候只能靠電腦模擬找出最佳的結構了。

By Emma
at 2013-11-30T22:00

好多年前有一個德國的group號稱找到一個新的binding pocket
可以用來設計藥物治療flu，好像也沒有聽見後續成果出來 XD

By Barb Cronin
at 2013-12-05T05:32

事實上, 大部分用電腦模擬僅限論文, 而事實上是可用

By Jessica
at 2013-12-05T19:01

在低成本取代高通量篩選上, 電腦模擬目前會沒成果
大多是製藥門檻實在過高, 模擬者又大多是學生之流
自然不太會有啥成果

By Mary
at 2013-12-08T22:18

只是, 光以物理學來說, 電腦模擬是可行的, 目前只卡在
需要動物實驗人體實驗等, 做為初步篩選理當可行才是

By Faithe
at 2013-12-12T16:19

如果結合醫藥生技, 理論上應可以做製藥的前端不是?
就是讓藥物都已經理論確定, 藥廠只要做動物和人體實驗

By Daniel
at 2013-12-15T20:44

大藥廠也有在做預測啊，但是你最後還是要跟HT篩到的藥一起比

By Ingrid
at 2013-12-16T17:54

因為後續實驗的成本太高，時程太長，加上科技日新月異。

By Cara
at 2013-12-19T11:50

HT的效率越來越高。電腦預測相對就沒有優勢了。

By Genevieve
at 2013-12-24T00:08

在前端捨棄HT節省的成本，可能在後面細胞實驗或者動物實驗

By Caitlin
at 2013-12-27T17:11

就要吐出來。HT篩到的藥經過最佳化後通不過動物實驗的也很多

By Ina
at 2013-12-31T00:53

但是預測的方式可以給我們一些information 比如大概哪些
core structure的compound比較有希望當你在看HT篩出來的結
果的時候，就會心裡有底

By Liam
at 2014-01-04T06:28

甚至一個compound在HT篩到，電腦又預測到，那就很有希望了

By Catherine
at 2014-01-08T11:57

HT跟Modeling都只是藥物設計的一小段....後面還有漫漫長路...

By Gilbert
at 2014-01-09T03:29

相對的後面有太多的ADMET-directed structure modification

By Noah
at 2014-01-10T13:33

由於跟enzyme binding無關，不論是HT或Modeling都看不出來~

By Ula
at 2014-01-12T21:02

所以我說如果piimaila您的公司可以把這個系統做得又快又好
大廠不止會外包他們的計劃甚至會直接買斷您的公司

By Lucy
at 2014-01-15T11:20

但前提是您的公司要有獨門技術，不能只是買套裝軟體回來跑..

By Charlotte
at 2014-01-19T22:21

Accelrys

By Zenobia
at 2014-01-24T06:04

瞭解了^^ 感謝各位先進的回答

By Delia
at 2014-01-25T10:17

對了我想問一下, 為啥要重複做呢? 電腦預測事實上
是採用簡單的物理原則而已, 換言之, 電腦預測不到

By Odelette
at 2014-01-25T19:34

或者說預測試失敗的藥物, ht無論如何此藥物也不可能

By Noah
at 2014-01-28T20:54

結合成功不是? 所以如果電腦預測夠快, 應該在ht之前?

By Caitlin
at 2014-02-01T15:01

甚至可以說, 電腦預測成功ht就必定成功, 這樣若電腦預測
速度比ht快, ht就可以不用做不是?

By Yuri
at 2014-02-02T18:13

ht預測成功的範圍, 有可能小於電腦預測的範圍嗎?

By Agnes
at 2014-02-04T00:13

這是很好的問題。問題有兩個：
1. 用來做model的蛋白質結構是否完全正確？

By Tristan Cohan
at 2014-02-07T06:40

2. 你的資料庫裡面的compound是否足夠多？

By Christine
at 2014-02-11T14:20

恩, 換言之, 電腦預測要實用, 前提必須蛋白質完全正確

By Olivia
at 2014-02-12T03:51

且配體要夠多且正確, 我可以這樣理解嗎?
如果能達到以上兩點, 事實上HT可以完全不做, 如果不能
ht還是無法省略的程序. 是否如此呢?

By Brianna
at 2014-02-14T14:08

理論上是這樣。但是你還要考量compound-protein binding
的環境，subcellular localization，其他protein的參與

By Kyle
at 2014-02-15T05:09

modeling省略的東西太多，HT則是直接找有活性的compound
我是不認為最終有用modeling取代HT的一天。

By Kyle
at 2014-02-16T01:21

還有，你也必須要先知道那個pocket真的是重要的 XD

電腦模擬蛋白質製藥的需求? - 生技

All Comments

Related Posts

臺灣藥廠管理職薪資

光量生技

國衛院的癌症研究中心？

台灣鮭基因解碼防近親繁殖

國衛院的癌症研究中心？