Re: 請教 目前大家對bioinformatics的看法 - 生技

Leila avatar
By Leila
at 2005-06-29T04:15

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※ 引述《sherylcrow (鱸鰻阿德)》之銘言:
: 以我們lab做affymetrix human genomic u133 plus2為例,
: 我們做了十三片,一片近五萬元....
: 有些做了 repeat,用統計計算片與片之間的相關系數R值至少有0.95以上.

唔...好神...
可以請問一下你在算R值的時候有算進一大堆低表現量的基因嗎?
那可能就是高R值的來源...

另外以u133 plus2而言
其穩定性仍舊是學術研究的等級
他的規格書裏也有寫明
"For research use only. Not for use in diagnostic procedures."
就是因為臨床醫療上所要求的穩定性標準比學術研究要高得多

你最後說的"選出具代表性的基因"確實是重點
像u133 plus2這麼多點的array,相對上來講穩定性就比較低 (還好它是Oligo)
那只是在研究初期亂槍打鳥用的
如果可以透過一連串大規模的實驗
確實的針對某種疾病找到可靠的marker,並藉此縮減點數
穩定性就會提高許多
價格也才有可能cost down

Anyway, 如同我想表達的,這些都還只是未來的願景
做學術研究ok
但在臨床醫療上還是保守一點的好

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※ 編輯: nightcatman 來自: 61.228.78.6 (06/29 04:19)

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All Comments

Re: 請教 目前大家對bioinformatics的看法

Caitlin avatar
By Caitlin
at 2005-06-29T03:26
原文恕刪. 我覺得microarray的data,還是其可信度的. 以我們lab做affymetrix human genomic u133 plus2為例, 我們做了十三片,一片近五萬元.... 有些做了 repeat,用統計計� ...

Re: 系統生物學與代謝工程

Charlotte avatar
By Charlotte
at 2005-06-29T00:59
我很高興越來越多人對SB這種東西感興趣 但是真的 我覺得真的要小心區分and#34;前景and#34;和and#34;現實and#34; and#34;前景and#34;人人會講,大家也都看得到 但 ...

Re: 請教 目前大家對bioinformatics的看法

Margaret avatar
By Margaret
at 2005-06-29T00:34
我也很高興您對microarray有如此高的信心 我只是想提醒您,目前還沒有那麼好 您如果是臨床醫師,對這種東西用起來應該要更加小心 病人的生命掌握在您� ...

Re: 系統生物學與代謝工程

Iris avatar
By Iris
at 2005-06-29T00:29
很感謝,前輩您許多comment ※ 引述《nightcatman (夜貓)》之銘言: : 跨領域整合溝通的確很重要 : 不過知道要做整合是一回事,真正在做整合又是另一回事 ...

Re: 請教 目前大家對bioinformatics的看法

Jacky avatar
By Jacky
at 2005-06-28T23:32
一直高興聽到您不同觀點和論點 ※ 引述《nightcatman (夜貓)》之銘言: : 但終究您還是個user : 對於microarray從設計階段開始一直到最後結果出來 : 其間的 ...