Re: 請教 目前大家對bioinformatics的看法 - 生技
By Leila
at 2005-06-29T04:15
at 2005-06-29T04:15
Table of Contents
※ 引述《sherylcrow (鱸鰻阿德)》之銘言:
: 以我們lab做affymetrix human genomic u133 plus2為例,
: 我們做了十三片,一片近五萬元....
: 有些做了 repeat,用統計計算片與片之間的相關系數R值至少有0.95以上.
唔...好神...
可以請問一下你在算R值的時候有算進一大堆低表現量的基因嗎?
那可能就是高R值的來源...
另外以u133 plus2而言
其穩定性仍舊是學術研究的等級
他的規格書裏也有寫明
"For research use only. Not for use in diagnostic procedures."
就是因為臨床醫療上所要求的穩定性標準比學術研究要高得多
你最後說的"選出具代表性的基因"確實是重點
像u133 plus2這麼多點的array,相對上來講穩定性就比較低 (還好它是Oligo)
那只是在研究初期亂槍打鳥用的
如果可以透過一連串大規模的實驗
確實的針對某種疾病找到可靠的marker,並藉此縮減點數
穩定性就會提高許多
價格也才有可能cost down
Anyway, 如同我想表達的,這些都還只是未來的願景
做學術研究ok
但在臨床醫療上還是保守一點的好
--
※ 編輯: nightcatman 來自: 61.228.78.6 (06/29 04:19)
: 以我們lab做affymetrix human genomic u133 plus2為例,
: 我們做了十三片,一片近五萬元....
: 有些做了 repeat,用統計計算片與片之間的相關系數R值至少有0.95以上.
唔...好神...
可以請問一下你在算R值的時候有算進一大堆低表現量的基因嗎?
那可能就是高R值的來源...
另外以u133 plus2而言
其穩定性仍舊是學術研究的等級
他的規格書裏也有寫明
"For research use only. Not for use in diagnostic procedures."
就是因為臨床醫療上所要求的穩定性標準比學術研究要高得多
你最後說的"選出具代表性的基因"確實是重點
像u133 plus2這麼多點的array,相對上來講穩定性就比較低 (還好它是Oligo)
那只是在研究初期亂槍打鳥用的
如果可以透過一連串大規模的實驗
確實的針對某種疾病找到可靠的marker,並藉此縮減點數
穩定性就會提高許多
價格也才有可能cost down
Anyway, 如同我想表達的,這些都還只是未來的願景
做學術研究ok
但在臨床醫療上還是保守一點的好
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※ 編輯: nightcatman 來自: 61.228.78.6 (06/29 04:19)
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