巨量資料 解讀基因 個人化醫療時代到來 - 生技

Jacky avatar
By Jacky
at 2014-03-05T00:56

Table of Contents

※ [本文轉錄自 Doctor-Info 看板 #1J5WLbYF ]

作者: NIFTY (NIFTY) 看板: Doctor-Info
標題: [新聞] 巨量資料 解讀基因 個人化醫療時代到來
時間: Wed Mar 5 00:54:58 2014

G oogle等資訊科技公司也非常積極投資新興的生物科技公司。大量收集與某種治療法的
效果相關的患者情報,再與基因情報相互對照而成「巨量資料診斷書」,附加價值便由此
而生。

花費1,000美元(約新台幣3萬元)就能讀取個人基因組(genom e)資料的時代已經到來
。利用「巨量資料(B ig D ata)」來尋找疾病發生的原因和有效的治療法,新時代的醫
學技術已逐漸呈現在世人眼前。

來到東京大學醫科學研究所的人類基因組解析中心,進入電腦室後,即使脫掉了厚重的外
套,卻依然熱得滿身大汗。

這裡的溫度高達29度,熱氣來源是兩台超級電腦,它們所擁有的計算能力,相當於1萬
1,000台以上的個人電腦。為了運用大量的數據,大型的儲存裝置也在室內一列列並排,
容量相當於4萬4,000台100G B的硬碟。

解析中心的教授宮野悟說明,他們盡可能不要把空調開得太強,是為了降低機器必須不分
晝夜全天候運作的成本。

專精於情報科學的宮野,和研究癌症的學者們共同執行這個專案計畫。他說:「對於現在
的癌症研究而言,數學和超級電腦已是不可或缺的輔助工具。

解讀基因組成本大降

在90年代,國際人類基因組解析計畫中想要解讀一個人的基因資料,就需花費約一年的時
間和約3,000億日圓(約新台幣900億元)的巨資。然而,現在使用美國的商用最新機種,
即可在一天左右,利用高速模式將一人份的基因資料解讀完畢。

以技術進步的速度來看,也許今年能實現在五到六個小時之內、利用1,000美金的代價,
將一個人全部的基因組解讀完。此外,基因組解析裝置的尺寸也越來越小,有企業宣告,
將開發出僅有手掌大小的裝置,並以「家電級」平易近人的價格販售。

這些大量的基因組情報,也促使醫學研究產生了許多新的觀點。例如癌症的解讀,正可利
用大量基因組資料取得突破。癌症是一種由D N A 損傷(或是突變)不斷累積、致使細胞
無法停止增殖而引發的疾病。將正常的組織和癌細胞的基因組相互比較,並用超級電腦進
行解析之後,我們可以判斷,從父母身上得到的遺傳基因是什麼、又有哪些是因為環境而
累積的突變。經由這些大量的數據,可以解讀出癌症從潛伏期至發病前的所有可能與變化
,進而對對癌症的治療研究有所幫助。

於是,癌症研究人員、加上像宮野這樣的「生物資訊學(bioinform atics)」專家、以
及超級電腦的三位一體,為現代醫學打開了新的門扉。多重基因檢測將是治癌關鍵臨床應
用也正在發展所謂的「基因診斷」,根據基因異常種類的不同,採取不同的治療方針。其
中,針對肺癌的治療方式率先走上第一線。

在日本國立癌症研究中心研究所裡,擔任癌症基因組研究學科長的柴田龍弘預測,在不久
的將來,癌症的治療將會有重大改變。

他認為:「光是針對肺癌這樣的單一疾病,我們就有多達10種以上的可能問題基因、以及
其對應藥劑的組合。這讓我們必須一個一個嘗試、調查,直到找出真正的問題所在,而患
者身上的癌細胞就會在這些嘗試的過程中,不斷地惡化。因此我認為未來癌症的治療法,
將會改為『多重基因(m ultigene)檢測』,從一開始就一口氣調查所有可能有問題的基
因。而是否能快速、無遺漏、大數量、且正確地檢測,將成為治療癌症的關鍵。」癌症研
究中心去年開始研究開發了一種可以鎖定目標基因、然後用次世代序列檢測裝置(
sequencer),進而解讀的「癌症基因組診斷面板」。這個裝置,可以一次檢測約130組基
因。

不少企業相繼加入結合基因檢測情報和醫療數據庫的領域,包括以解讀出來的基因組數據
為基礎,提供治療方針建言的「基因檢測服務」。

有趣的是,G oogle等資訊科技公司也非常積極投資這類新興的生物科技公司。大量收集
與某種治療法的效果相關的患者情報,再與基因情報相互對照而成「巨量資料診斷書」,
新的附加價值便由此而生。

仍需面對醫療倫理問題

目前社會上有越來越多人開始期望,這些基因情報或許能進一步運用於預防疾病產生。只
是,像高血壓、糖尿病等常見的疾病,是與遺傳因素和環境因素(吸菸或飲酒等)兩者都
有相關性的「多因素疾病」。據了解,造成人體易於罹患此類疾病的原因,基因的影響程
度僅有二到三成,最多也不過是五成。

好萊塢女星安潔莉娜裘莉因帶有基因缺陷,進行了雙乳切除手術以預防乳癌發生。但是,
一般的大腸癌、胃癌、乳癌等,遺傳因素和環境因素又各有多少程度的影響呢?這個問題
目前尚未獲得解答,會得病人和不會得病的人之間的差異,將經由長時間的追蹤研究來一
一釐清。

現在,癌症研究中心已經建置完成所謂「生物資料庫(B iobank)」系統,將針對所有初
診病患採取血液樣本,對於進行過手術的癌症病患,則會採取其組織樣本保存。這些樣本
資料,也包含了經由遺傳而得的「體質」情報。

癌症研究中心的研究所長中釜齊表示,這些資料可能會讓患者發現完全沒有預料到的、癌
症以外的遺傳疾病因子,像是神經方面的重度疾病或阿滋海默症等,如此一來,便會浮現
「知的權利」和「不想知道的權利」等問題。這些「研究」中所得到的情報,應將以何種
形式反饋回醫療現場?針對這個問題,中釜認為:「今後,在發展基因研究的同時,我們
也必須同時展開倫理社會方面的議論才行。」

新聞來源 全球中央雜誌 via Yahoo! 奇摩新聞 : http://ppt.cc/6efu

--
Tags: 生技

All Comments

填問卷送全家百元禮卷一張

Liam avatar
By Liam
at 2014-02-26T16:26
資料庫重新開啟,再煩請尚未填寫過問卷的企業先進協助填答,麻煩您了,謝謝您! 敬祝 順心 ^_____^ https://www.surveymonkey.com/s/EO_CSR_NSC ※ 引述《catalin ...

offer選擇 五鼎生技&太平洋醫材

Audriana avatar
By Audriana
at 2014-02-24T16:29
各位大大 小弟想請教一下關於五鼎生技與太平洋醫材 目前兩間都已經電話通知錄取了 公司 五鼎生技 太平洋醫材 地點 竹科 ...

春菖貿易有限公司

Carol avatar
By Carol
at 2014-02-22T21:43
各位大大好, 近來春菖貿易有限公司找我去做醫療器材法規註冊專員, 兩次接觸下, 覺得這間公司非常尊重人,且十分有誠意, 看了這間公司的首頁 ...

益生菌OEM業務有發展性嗎!?

Hamiltion avatar
By Hamiltion
at 2014-02-22T01:15
各位大大好,小弟剛好有榮幸收到生技公司的面試邀約 工作內容主要是做OEM、ODM的益生菌保健食品、化妝品代工業務 不知此產業目前狀況及未來前景� ...

寶齡夥伴腎病新藥獲日藥證,創下首例

Charlie avatar
By Charlie
at 2014-02-20T17:19
寶齡富錦(1760)日本再授權合作夥伴JT/Torii宣布,成功取得日本厚生省核發    Riona Tablets 250mg新藥製造與銷售許可。該新藥於日本核准適應症為治療慢 ...