電腦模擬蛋白質製藥的需求? - 生技

※ 引述《piimaila (肥仔)》之銘言：
: ※ 引述《ljii (是否)》之銘言：
: : HTS說穿了就很多很多種藥物然後讓機器人幫你作投藥跟收data的動作罷了,
: 所以廠商基本上是亂槍打鳥? 還是預先知道藥物範圍?


要說藥廠亂槍打鳥也是可以 不過這些HTS通常藥廠自己內部會先做

比較少全部會交給pre-clinical公司

有些藥廠自己內部做完初步篩選之後 再交給pre-clinical公司

這時候他們就有可能已經知道哪些藥是有效(會跟receptor結合 or 引發下游訊號)

甚至已經知道某個特定濃度是IC50或EC50

當然也會有完全自己沒測試過的 就是不知道自己做出來的藥有沒有效

這也是有的


: : 直接拿一百萬個藥去作HTS, 有100個well裡的細胞死掉了
: 這樣費用大概多少, 我參考一下興大的費用
: 1 X 96 （每次篩選一個樣品）： 新台幣 9,800 元
: 這樣是說 一次一個蛋白質樣品, 測試96種化合物
: 是不是這樣呢? 當然 做多是有優惠, 但是一次拿100萬個事不是成本非常高?


你看的是台灣的價格 其實台灣真正有在開發新藥的公司非常少

HTS這塊在台灣業界根本還用不到

收費多少 國際上一些公司的價錢通常是 well/60~100$ USD

別懷疑 就是這樣 不管是96或1536 一個well就是台幣一千元以上

藥廠不會拿一百萬個要去篩 他們自己內部會先篩

怎麼篩? 這是每家藥廠的內部機密

篩完之後 交給pre-clinical公司的藥量通常是100~1000之間

一支新藥

檢測receptor的話 可能只測一個濃度 藥廠沒在做三重覆的 通常是dupicate 兩個well

檢測下游訊號 一般都3~5個濃度 總共6~10個well

可以自己算算一支新藥要花多少錢


: 那實務上又如何縮小範圍?
: : 所以"僅"通過電腦篩選的都還需要進行大量的細胞和動物試驗
: : 距離實際可用的資料還有很長的距離
: : 以這種低期望值的資料來說, 商業價值可能不會很高
: 恩, 這樣 用電腦預測和用HTS的預測差在哪裡呢?
: 是否通過HTS預測的就不需要細胞和動物實驗?

不可能不做細胞跟動物實驗


: 如果 HTS一樣得通過細胞和動物實驗 這樣為啥要選擇HTS不選擇電腦篩選?
: 兩者之間的差距差在哪裡呢?
: 恩, 補問一個, 所謂的市場價值不是很高是大概一個可能性多少錢呢?
: 是否有交易成功的案子可以參考?.?


另外 在藥物跟receptor結合方面 藥物結合角度 卡的位置如何

這些是藥廠會自己去分析 設計 改良

pre-clinical實驗方面 只要結合就是結合 不會管你是哪個方位哪個角度

下游訊號也是

結合角度跟方位的影響 只有在進入動物階段才可以看出影響為何

另外 pre-clinical沒人在考慮什麼細胞質中一堆其他蛋白or 其他蛋白的干擾

真正好的藥物 是非常非常specific的

所以 在進行pre-clinical檢測時

所使用的receptor沒人在純化然後跟藥物檢測的

都是整坨整坨tissue 細胞均質完之後直接下去反應


電腦的分析 是不可能取代傳統的分析實驗的

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